En 1972 fue creado el Centro de Estudios Sociales y Filosóficos (CESYF). Su propósito era formar recursos humanos en Economía, Filosofía, Ciencia Política y Sociología con la perspectiva, a mediano plazo, de conformar licenciaturas en esas áreas. En 1975 el Centro se reestructuró e integró como Instituto, con la finalidad de articular la formación de recursos humanos con la investigación social, aun cuando el Instituto funcionaba más bien como un centro de información y divulgación.
Fue hasta 1990 cuando se inició propiamente la investigación social; se definieron líneas de investigación que dieron soporte a diferentes proyectos. Ese mismo año el Instituto amplió su planta de investigadores.
En 1993 se formuló, por integrantes del personal académico del Instituto y con el apoyo de un asesor externo, un plan de desarrollo institucional para la propia unidad en el que se plasmó un esquema de campos y líneas de investigación para orientar los proyectos que se realizaran. Ese mismo año se estableció un acuerdo con otras universidades para la constitución de un centro de estudios demográficos, uno de cuyos propósitos era realizar estudios sobre los movimientos migratorios en la región.
Desde su nacimiento, como Centro de Estudios Sociales y Filosóficos, el hoy Instituto de Ciencias Sociales, tuvo como sede una casona ubicada en el centro de la ciudad; contaba entonces con una biblioteca, aulas y un espacio para administración. Posteriormente, en el predio Canoas, ya como Instituto se cambió a un edificio especialmente pensado y diseñado para él. Pero el crecimiento en la plantilla de investigadores, así como la ampliación de sus funciones provocó que el lugar resultase insuficiente e inadecuado para el buen desempeño de las actividades.
A partir del año 2008 el Instituto de Ciencias Sociales se encuentra ocupando su espacio físico en la Torre de Institutos de la UJED ubicado en Blvd. Guadiana #501 en la Ciudad Universitaria. Cabe hacer mención que la plantilla académica ha crecido y está integrada por investigadores de tiempo completo, de medio tiempo y hora-semana-mes. Actualmente, son 4 investigadores los que pertenecen al SNI y el mismo número de investigadores cuentan con Perfil PRODEP. Se cuenta con dos Cuerpos Académicos “en consolidación” uno por parte de la SEP, uno por parte de la UJED. Además. En conjunto con dos Unidades Académicas de la UJED, es sede de la Maestría en Ciencias y Humanidades, posgrado que forma parte del Programa Nacional de Posgrados de Calidad del CONACYT.
Durante el año 2020 -con el apoyo del Rector Rubén Solís Ríos y la Administración Central- se logró la aprobación, por parte de la H. Junta Directiva de nuestra Universidad, de la Licenciatura en Filosofía. La primera generación inició durante el mes de febrero del año 2021. Lo anterior es un reflejo de una mayor madurez en la investigación realizada en el Instituto de Ciencias Sociales.